孔薇


一、基础信息

个人简介:孔薇,女,汉族,197710月生,河北石家庄人,中共党员,博士研究生学历,教授。主要从事智能计算及机器学习方法在多模态高通量大数据、图像处理以及生物信息在人类复杂疾病致病机理探寻中的应用。作为项目负责人主持国家自然科学基金、上海市自然科学基金、上海市科委科技启明星人才计划等多项科研项目;在国内外权威期刊上发表SCI检索论文多篇。

(一)个人基础信息

性别:女

出生年月:197710

职务:教授

博硕导:硕士生导师

电子邮箱:weikong@shmtu.edu.cn

(二)教育经历

2005年于上海交通大学模式识别与智能系统专业,取得博士学位。

(三)工作经历

2005年至今,就职于上海海事大学信息工程学院,教师。

(四)国际交流与合作经历

2007.9-2008.9曾前往美国哈佛大学,任访问学者。

二、科学研究

(一)研究领域及科研团队

研究领域:模式识别与智能系统;智能计算与生物信息学

科研团队:数字影像与智能计算

(二)科研项目

1. 阿尔茨海默症免疫失调转录调控机制的多组学数据关联分析算法研究,上海市科委自然科学基金项目(18ZR1417200)2018.5-2021.4,主持;

2. 基于炎症反应的阿尔茨海默症基因表达调控网络构建研究,国家自然科学基金面上项目(61271446)2013.1-2016.12,主持

3. 基于独立成分分析探寻阿尔茨海默症特异性生物标志的研究,国家自然科学基金青年项目(60801060), 2009.1-2011.12,主持;

4. 基于智能计算的基因调控网络预测模型研究,上海市科委青年科技启明星人才资助项目 (11QA1402900)2011.4-2013.4,主持;

5.基因信号传导通路的模式识别方法研究,上海市教委科研创新项目(11YZ141)2011.1-2013.1,主持;

6.基于多生物数据融合及多疾病联合探寻阿尔茨海默症致病信号传导通路,上海市教委科研创新项目(15ZZ079)2015.1-2017.12,主持。

    

(三)代表性论文成果

近年来,以第一作者(共同一作)发表的代表性论文成果:

1.      Wei Kong#*, Yufang Xu#, Shuaiqun Wang, Kai Wei, Gen Wen, Yaling Yu, Yuemin Zhu, A Novel Longitudinal Phenotype-Genotype Association Study Based on Deep Feature Extraction and Hypergraph Models for Alzheimer's Disease, Biomlecules, 2023, 13, 728. 
2.      Wei Kong#*, Feifan Xu#, ShuaiqunWang, Kai Wei, Gen Wen, Yaling Yu, Application of orthogonal sparse joint non-negative matrix factorization based on connectivity in Alzheimer’s disease research, Mathematical Biosciences and Engineering, 2023, 20(6): 9923–9947.
3.Wenliang Gao#, Wei Kong#*, Shuaiqun Wang, Gen Wen, Yaling Yu, Biomarker Genes Discovery of Alzheimer’ s Disease by Multi-Omics-Based Gene Regulatory Network Construction of Microglia, Brain sciences, 2022, 12, 1196. 
4. Kai Wei#, Wei Kong#*, Shuaiqun Wang, Integration of Imaging Genomics Data for the Study of Alzheimer's Disease Using Joint-Connectivity-Based Sparse Nonnegative Matrix Factorization, Journal of Molecular Neuroscience2022 Feb;72(2):255-272. 
5. Kai Wei#, Wei Kong#*, Shuaiqun Wang, Associating brain imaging phenotypes and genetic in Alzheimer's disease via JSCCA approach with autocorrelation constraints, Medical & Biological Engineering & Computing, 2022 Jan, 60(108), pp. 95-108. 
6. Wenbo Wang#, Wei Kong#*, Shuaiqun Wang, Kai Wei, Detecting Biomarkers of Alzheimer’s Disease Based on Multi-constrained Uncertainty-Aware Adaptive Sparse Multi-view Canonical Correlation Analysis, Journal of Molecular Neuroscience, 2022 Apr; 72(4):841-865. 
7. Fengchun Ke#, Wei Kong#*, Shuaiqun Wang, Identifying Imaging Genetics Biomarkers of Alzheimer’s Disease by Multi-Task Sparse Canonical Correlation Analysis and Regression. Frontiers in Genetics. 2021 Aug, 12:706986.
8. Tao Zhang#, Wei Kong#*, Shuaiqun Wang and Xiaoyang Mou, Association Analysis of Peripheral and CSF Biomarkers in Late Mild Cognitive Impairment, Frontiers in Genetics, 2020 Aug 12;11:834.

三、教学信息

(一)授课信息

主讲本科生课程:自动控制原理

主讲研究生课程:模式识别

四、其它成果或荣誉

(一)其它荣誉

1.      三八红旗手,校级,上海海事大学,2012年;

2.       上海市教育系统巾帼建功标兵,市级,上海市,2013年;

3.      优秀硕士生导师;校级,上海海事大学,2015,

4.      刘浩清优秀教师奖,校级,上海海事大学,2018年。



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